反滲透(RO)非常致密，對病毒、噬菌體和細菌具有非常高的脫除率，至少在3log以上(脫除率>99.9%)。但是還須注意的是，在很多情況下，膜產水側仍可能會出現微生物再次滋生，這主要取決于裝配、監測和維護的方式，就是說，某一個系統的脫除微生物的能力關鍵取決于系統設計、操作和管理是否恰當而不是膜元件本身的性質。